细菌基因组测序
新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间,让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求,细菌基因组测序可分为四种类型:细菌基因组Scanning、细菌基因组
Solid 4二代测序
SOLiD 4是由ABI公司研发的新一代超高通量基因测序分析系统。该系统采用结合在磁珠上单分子DNA片段簇为测序模板,以四色荧光标记寡核苷酸进行连续的连接反应为基础,对扩增的DNA片段进行大规模高通量测序。
基因组重测序(Re-sequencing)
使用的Illumina Genome Analyzer平台只需要极少量的样品,便可对数量有限的保存组织、拟胚体、小的模式系统和难以培养的生物进行测序。
细菌基因组完成图测序服务
通过基于PacBio第三代测序和Illumina二代测序,根据菌株具体情况制定最优策略,最终得到一条完整的基因组序列(1 contig,0 gap),是细菌基因组测序的最高要求。
宏基因组测序
宏基因组测序是指对样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序,进行序列组装和基因注释,获得部分不可纯培养微生物的基因组序列,分析该环境下所有微生物基因集信息。
微生物Meta测序
16S rDNA序列(在所用物种中高度保守)是最常用的细菌分类标准,通过提取环境样品的DNA,并扩增其中16S rDNA基因;通过检测16S rDNA 的序列变异和丰度,反映环境样本中细菌的分类和丰度